研发费用加计扣除政策是一项重要的税收优惠政策，旨在鼓励企业加大研发投入，提高创新能力。不过近期研发费用加计扣除被税务稽查的案例屡见不鲜，被稽查企业研发费用的风险涉及方方面面的内容，以下为几个比较有代表性的稽查案例：
【案例一】
某企业被税务稽查认定为虚构研发项目、虚报研发费用偷税被要求补税罚款滞纳金合计 180 万！2024 年 4 月 28 日，国家税务总局阜阳市税务局第一稽查局公布了一起案件，某科技企业因虚构研发项目、虚报研发费用，企图“吃”国家税收优惠的“免费午餐”，结果被依法查处，不仅需补缴税款104 万元，还额外承担了滞纳金和罚款，总金额高达 180 万元！
【案例二】
宁波某公司因为废料收入没有冲减研发费用被税务稽查，违法事实如下：2020 年至 2022 年，你单位研发新产品试制中产生废料收入合计227159.29 元，具体为：2020 年有废料收入 51327.43 元，已冲减研发费用 15103.60 元，其余 36223.83 元已享受税前加计扣除（75%），导致少缴 2020 年企业所得税 1358.39 元；2021 年有废料收入 82150.44元，未冲减研发费用，全额享受税前加计扣除（100%），导致少缴2021 年企业所得税 2053.76 元；2022 年有废料收入 93681.42 元，已冲减研发费用 12560.80 元，其余 81120.62 元已享受税前加计扣除（100%），导致少计 2022 年应纳税所得额 81120.62 元。（上述内容摘自“甬税稽一罚〔2024〕35 号”）
【案例三】
2023 年下半年，某企业因年度企业所得税汇算清缴申报时研发费用风险推送被税务局约谈，并被要求补充提供相关资料。具体风险推送内容为：
1.根据风险疑点明细—扩展信息提示，该纳税人 2022 年度汇算清缴申报中年度研发费用 526,679.28 元，2022 年度财务报表选择适用执行企业会计制度的企业，“利润表”无“研发费用”栏，数据提取有误，风险不能被准确指向。
2.该纳税人 2022 年度汇算清缴申报“A107012 研发费用加计扣除优惠明细表”中“无形资产摊销额”为 12,801.76 元，但“A105080资产折旧、摊销及纳税调整明细表”中第 22 行专利权 24 行著作权26 行非专利技术 28 行软件的第 5 列税收摊销额为 0 元，可能存在虚增无形资产摊销进行加计扣除的风险。
随着近两年研发费用被风险推送及税务稽查补税案例的增多，研发费用加计扣除风险的增大，对于希望享受研发费用加计扣除税收优惠政策的企业也需要更加注意研发费用的合规性处理，在此笔者也建议大家从以下几个方面来加强研发费用加计扣除税务风险的防控，以便应对后续可能存在的税务局风险推送或者税务稽查，安心放心享受研发费的加计扣除税收优惠：
首先，企业要确认自身是否符合研发费用加计扣除的政策
（一）是否属于可享受税前加计扣除政策的行业
除烟草制造业、住宿和餐饮业、批发和零售业、房地产业、租赁和商务服务业、娱乐业等以外，其他行业企业均可享受。
（二）是否属于下列不适用加计扣除活动所产生的研发费用
1.企业产品(服务)的常规性升级；
2.对某项科研成果的直接应用，如直接采用公开的新工艺、材料、装置、产品、服务或知识等；
3.企业在商品化后为顾客提供的技术支持活动；
4.对现存产品、服务、技术、材料或工艺流程进行的重复或简单改变；
5.市场调查研究、效率调查或管理研究；
6.作为工业(服务)流程环节或常规的质量控制、测试分析、维修维护；
7.社会科学、艺术或人文学方面的研究。
（三）是否按研发费用加计扣除政策的要求设置研发支出辅助账财税〔2015〕119 号文件对研发费用会计核算提出了若干要求：
1.遵照国家统一会计制度：企业应按照国家财务会计制度要求，对研发支出进行会计处理。
2.设置研发支出辅助账：对享受加计扣除的研发费用，按研发项目设置辅助账，准确归集核算当年可加计扣除的各项研发费用实际发生额。企业在一个纳税年度内进行多项研发活动的，应按照不同研发项目分别归集可加计扣除的研发费用。企业研发费用各项目的实际发生额归集不准确的，税务机关有权对其税前扣除额或加计扣除额进行合理调整。
3.研发费用与生产费用分别核算：企业应对研发费用和生产经营费用分别核算，准确、合理归集各项费用支出，对划分不清的，不得实行加计扣除。
其次，企业要判断自身是否存在如下可能会被风险推送的情形：
（一）委托、合作研发的项目合同未经科技行政部门登记
（二）因享受研发费用加计扣除导致企业所得税退税
（三）研发活动支出占公司同类型总支出比例过高
1.直接从事研发费用人员的工资薪金全公司人员工资薪金总额的比例过高。
2.直接从事研发费用人员的五险一金占全公司人员五险一金总额的比例过高。
3.研发活动直接消耗的材料、燃料和动力费用占全部加计扣除金额比例过高。
4.研发费用占收入总额比例过高。
（四）研发人员存在异常
1.研发立项报告人员和专利证书人员不一致，且专利证书人员不是本公司编制。
2.研发人员工时、工作内容相近但时薪相差较高。
（五）研发材料或者耗材存在异常情形
1.研发领用材料未实际投入研发活动。
2.研发回收废料未冲减研发费用支出。
再次，企业要积极整理备查所需的资料。
（一）相关税务法规明确要求备查的资料
1.研究开发项目计划书、决议文件；
2.研究开发专门机构或项目组的编制情况和研发人员名单；
3.经科技行政主管部门登记的委托、合作研究开发项目的合同，科技行政主管部门一般是指技术合同登记机构（针对的是存在委外研发、合作研究开发情形）；
4.从事研发活动的人员（包括外聘人员）和用于研发活动的仪器、设备、无形资产的费用分配说明（包括工作使用情况记录及费用分配计算证据材料）（比如采用按工时分配的，需提供工时分配表等）；
5.“研发支出”辅助账及汇总表（务必准备）；
6.企业如果已取得地市级（含）以上科技行政主管部门出具的鉴定意见，应作为资料留存备查；
7.税局要求的其他资料。
（二）笔者建议增加留存备查的资料
1 研发人员的五险一金购买证明，个税申报记录，考勤记录，研发项目的工时分配记录(人工工时)、工资支付记录等；
2.研发人员汇总表（含岗位、学历、学位、在职时间起止等）；
3.研发材料领用单、出库单、记账凭证；
4.研发产成品、废料、边角料、样品结转记录；
5.研发设备或仪器折旧、无形资产费用分配的工时记录；
需要注意的是，按照《国家税务总局公告 2018 年第 23 号》文件要求，企业留存备查资料应从企业享受优惠事项当年的企业所得税汇算清缴期结束次日起保留 10 年。
最后，企业要掌握高新企业认定、加计扣除和会计准则中关于研发费用的各项差异。
本文政策依据：
1.国家税务总局 2015 年第 97 号 《国家税务总局关于企业研究开发费用税前加计扣除政策有关问题的公告》
2.财税〔2015〕119 号 《财政部 国家税务总局 科技部关于完善研究开发费用税前加计扣除政策的通知》
3.国家税务总局公告 2017 年第 40 号 《国家税务总局关于研发费用税前加计扣除归集范围有关问题的公告》
4.财税〔2018〕64 号 《财政部 税务总局 科技部关于企业委托境外研究开发费用税前加计扣除有关政策问题的通知》
5.国家税务总局公告〔2021〕28 号 《国家税务总局关于进一步落实研发费用加计扣除政策有关问题的公告》
6.财政部 税务总局公告 2023 年第 7 号《财政部 税务总局关于进一步完善研发费用税前加计扣除政策的公告》